Sistema de Eventos Acadêmicos da UFMT, X Mostra da Pós-Graduação: Direitos Humanos, trabalho coletivo e redes de pesquisa na Pós Graduação

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Sequenciamento de genomas e bioprospecção de metabólitos bioativos produzidos por actinobactérias endofíticas isoladas de Guaraná [Paullinia cupana (Mart.) Ducke]
Katia Aparecida de Siqueira

Última alteração: 18-10-18

Resumo


Actinobactérias possuem um amplo espectro de atividades biológicas, incluindo antioxidantes, antitumorais, Imunossupressoras e antimicrobianos. O sequenciamento genômico tem auxiliado os estudos na área de produtos naturais possibilitando a montagem de genomas e identificação de genes regulados em determinadas condições de cultivo, além da identificação de novos produtos naturais. Os genomas das actinobactérias Streptomyces costaricanus-64 e S. griseocarneus-132 isoladas de P. cupana foram sequenciados. As bibliotecas foram preparadas com Kit Nextera DNA Library e o sequenciamento foi realizado em modo HiSeq4000. Para eliminar adaptadores e sequências de baixa qualidade utilizou-se o programa Trimmomatic. A montagem de novo do genoma foi feita através do software Spades e a anotação através da plataforma Rast, para detectar tRNA e rRNA foi utilizado Aragorn e RNAmmer, respectivamente. Os genomas consistiram em 180 scaffolds (S. costaricanus-64) e 271 (S. griseocarneus-132), representados em um cromossomo circular com um total de 8.381033 pb e 8.871927 pb, respectivamente. Os clusters relacionados a metabólitos secundários foram preditos pelo programa AntiSmash, a espécie S. costaricanus-64 apresentou 22% dos genes relacionados a biossíntese de  policetídeo sintase tipo 1 (T1PKS), 18% NRPS (Peptídeos não ribossomais), terpenos (11%),  Lantipeptideo (7%), butirolactona (4%) e bacteriocinas (2%). S. griseocarneus-132 apresentou 22% de genes relacionados a sintese de terpenos, 17% bacteriocinas e NRPS 11%. Este estudo auxiliará na pesquisa de engenharia metabólica de linhagens de Streptomyces e seu uso na biotecnologia.

Palavras-chave


Streptomyces; Sequenciamento; P. cupana; Clusters